＞新種牡馬産枠と父内国産枠だけ残して、あとは同一種牡馬禁止のみで十分だろう
そうですね。新種牡馬はあったほうがいいと思います。同一種牡馬禁止ならＳＳ産駒も一頭ですし。
外国産は枠を作るとカメさんのいうように「よくわからん」「情報が偏る」などがあると思いますね。
ただ枠を外すとして外国産指名の頭数制限はあるのでしょうか？

＞「ＳＳ産駒に勝負馬適用を認めるか否か？」
認めていいと思います。同一種牡馬禁止でどのみちＳＳ産駒は一頭に絞るわけですから。